精子头部缺陷率98%，也有使女性怀孕的可能。虽然精子头部缺陷率98%，加上其他部位缺陷的精子，可能正常形态的精子占比更小，但仍可能存在有正常形态的精子。因此精子头部缺陷率98%的情况，可能使女性怀孕，但流产率会有所上升，怀孕难度会增加。
精液常规检查精子头部缺陷百分之98，还是有希望生育的。通常情况下，男性精子头部缺陷率高都是由很多因素引起的，如抽烟喝酒、生活习惯不规律、饮食不健康、长期处在不良环境以及其他疾病因素等。所以要想提高生育能力，首先男性就要养成良好的生活习惯，戒烟戒酒，生活规律，同时还需要去医院做个全面的检查，查明精子头部缺陷高的原因，然后在医生的指导下对症治疗。
根据世卫组织的第五版精液检测标准，正常形态的精子比率大于4%，即表示精子正常，所以精子头部缺陷98%可以定义为轻度畸形精子症，这种情况容易导致不孕不育，即使怀孕也容易出现胎停或者流产。因此，精子畸形需及时就医治疗，以下是治疗精子畸形的方法，如下：
- 1. 如果是抽烟喝酒或者生活作息不规律导致的精子头部缺陷98%，那么就需要及时戒烟戒酒，规律作息，同时饮食尽量清淡，可多吃含锌的食物，提高精子质量；
- 2. 如果精子头部缺陷98%是接触高温、放射和化学环境等导致的，那么就需要及时远离致病源，从而逐渐降低畸形精子比率；
- 3. 如果是精索静脉曲张或者其他生殖器官疾病导致的，建议根据病症采取药物或者手术治疗，等病情恢复后，畸形精子比率就会下降。
精子畸形是指精子形态头部、身体和尾部形态异常。出现畸形精子通常与不良的生活习惯、精神压力、以及接触化学环境有关，不同的病因治疗方式不同，建议到正规医院门诊进行检查和治疗。如果以上操作均无法改善，可以选择辅助生殖技术，如试管婴儿等，达到生育目的。
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