试管婴儿移植嵌合体胚胎的确存在一定的风险，主要表现在多胎妊娠、流产等方面。一般来说嵌合的程度越高，移植后出现染色体异常的风险就越高，通常嵌合体胚胎的移植成功率在10-20%之间，相比正常的胚胎不太容易着床，即使着床能够成功，也很容易出现流产胎停的情况，建议患者谨慎移植嵌合型胚胎。
嵌合体胚胎是有部份染色体异常的胚胎，着床率相对正常胚胎来说会偏低一点，但随着胚胎细胞分裂也有一定机会纠错变回染色体正常的胚胎。一般情况下，移植嵌合体胚胎都是在同批次胚胎中没有获取到健康的胚胎才会考虑的，且嵌合的程度越高，移植后出现染色体异常的风险就越高，通常嵌合体胚胎的移植成功率在10-20%之间，相比正常的胚胎不太容易着床，即使着床能够成功，后续的胚胎发育过程中也有可能因为染色体异常而停育或必须中止妊娠，所以移植嵌合体胚胎要谨慎。
嵌合体胚胎分为多种类型，不同种类、不同嵌合比例的嵌合体胚胎移植后的后果也是不同的，在不得不选择移植嵌合体胚胎的情况下，通过对嵌合体胚胎的筛选来规避一些风险，也是有概率在后续的发育中得到健康的婴儿：
嵌合比例
嵌合体胚胎是否适合移植，首先取决于嵌合比例，通常最好嵌合比例是在40%以下，这样的嵌合体胚胎染色体异常的程度较少，胚胎自然淘汰的可能性相对来说会小一些，相应的给患者带来的风险也更小。
嵌合类型
嵌合胚胎分为全染色体嵌合、片状嵌合、复合嵌合三种，全染色体嵌合的危险最低。在全染色体嵌合类型中，以单倍体的嵌合胚胎为主为首选，常染色体单倍体嵌合的胚胎发育到正常情况下，出现染色体异常的危险相对较低。
一般移植嵌合体胚胎以后会需要患者做更多、更全面的检查，孕中或许还需要抽羊水来确定胎儿的发育是否正常，其他方面的情况产检大部份都能检查，但由于现代医学的局限性，也可能有少数的胎儿畸形或发育异常在产前无法检查出来，所以移植前一定要仔细考虑，不到不得已的程度尽量不要选择移植嵌合体胚胎。
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